Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC8A1P32418 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms