Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTX2P32243 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTX2P32243 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTX2P32243 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTX2P32243 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTX2P32243 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTX2P32243 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTX2P32243 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTX2P32243 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTX2P32243 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
OTX2P32243 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTX2P32243 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTX2P32243 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTX2P32243 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTX2P32243 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTX2P32243 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTX2P32243 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTX2P32243 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTX2P32243 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTX2P32243 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTX2P32243 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTX2P32243 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTX2P32243 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTX2P32243 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTX2P32243 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTX2P32243 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTX2P32243 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTX2P32243 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTX2P32243 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTX2P32243 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTX2P32243 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTX2P32243 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTX2P32243 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTX2P32243 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTX2P32243 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTX2P32243 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTX2P32243 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTX2P32243 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTX2P32243 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTX2P32243 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTX2P32243 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTX2P32243 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTX2P32243 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTX2P32243 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTX2P32243 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTX2P32243 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTX2P32243 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTX2P32243 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTX2P32243 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTX2P32243 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTX2P32243 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTX2P32243 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTX2P32243 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTX2P32243 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTX2P32243 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTX2P32243 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTX2P32243 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
OTX2P32243 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTX2P32243 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTX2P32243 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTX2P32243 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTX2P32243 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTX2P32243 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTX2P32243 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTX2P32243 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTX2P32243 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTX2P32243 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTX2P32243 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTX2P32243 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTX2P32243 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
OTX2P32243 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
OTX2P32243 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
OTX2P32243 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
OTX2P32243 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTX2P32243 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTX2P32243 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTX2P32243 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTX2P32243 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
OTX2P32243 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTX2P32243 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTX2P32243 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTX2P32243 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTX2P32243 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTX2P32243 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTX2P32243 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTX2P32243 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTX2P32243 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
OTX2P32243 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTX2P32243 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTX2P32243 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTX2P32243 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTX2P32243 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTX2P32243 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTX2P32243 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTX2P32243 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTX2P32243 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTX2P32243 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTX2P32243 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTX2P32243 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTX2P32243 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms