Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-FP30511 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-FP30511 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.3 ms