Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TM4SF1P30408 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TM4SF1P30408 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms