Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RBMS1P29558 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms