Protein–RNA interactions for Protein: P29350

PTPN6, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN6P29350 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN6P29350 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN6P29350 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN6P29350 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN6P29350 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN6P29350 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN6P29350 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN6P29350 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN6P29350 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN6P29350 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN6P29350 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN6P29350 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN6P29350 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN6P29350 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN6P29350 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN6P29350 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN6P29350 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN6P29350 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN6P29350 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN6P29350 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN6P29350 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms