Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD34P28906 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD34P28906 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD34P28906 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD34P28906 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD34P28906 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD34P28906 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CD34P28906 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD34P28906 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD34P28906 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD34P28906 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD34P28906 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD34P28906 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD34P28906 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CD34P28906 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CD34P28906 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD34P28906 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD34P28906 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD34P28906 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD34P28906 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD34P28906 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD34P28906 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD34P28906 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD34P28906 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD34P28906 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD34P28906 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD34P28906 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD34P28906 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD34P28906 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD34P28906 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD34P28906 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD34P28906 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD34P28906 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD34P28906 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD34P28906 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD34P28906 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD34P28906 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD34P28906 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CD34P28906 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD34P28906 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD34P28906 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD34P28906 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD34P28906 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD34P28906 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CD34P28906 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD34P28906 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD34P28906 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD34P28906 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD34P28906 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD34P28906 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD34P28906 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD34P28906 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD34P28906 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD34P28906 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD34P28906 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD34P28906 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD34P28906 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD34P28906 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD34P28906 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD34P28906 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD34P28906 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD34P28906 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CD34P28906 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD34P28906 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD34P28906 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD34P28906 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD34P28906 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD34P28906 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD34P28906 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD34P28906 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD34P28906 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD34P28906 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD34P28906 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD34P28906 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD34P28906 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CD34P28906 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CD34P28906 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CD34P28906 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CD34P28906 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD34P28906 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD34P28906 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD34P28906 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD34P28906 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD34P28906 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD34P28906 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD34P28906 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD34P28906 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD34P28906 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD34P28906 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD34P28906 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD34P28906 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD34P28906 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD34P28906 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD34P28906 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD34P28906 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD34P28906 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD34P28906 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD34P28906 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD34P28906 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD34P28906 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms