Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD1P28289 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD1P28289 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
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