Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.47■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.41■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
DNMT1P26358 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.35■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
DNMT1P26358 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms