Protein–RNA interactions for Protein: P26196

DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX6P26196 FGFR1-208ENST00000397108 2870 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.594e-6■■■■■ 36.6
DDX6P26196 CADM1-212ENST00000542447 4223 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.694e-6■■■■■ 36.6
DDX6P26196 MYBBP1A-202ENST00000381556 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.761e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 MYBBP1A-207ENST00000573116 3795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.69□□□□□ -0.861e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 CADM1-203ENST00000452722 8588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.874e-6■■■■■ 36.6
DDX6P26196 METTL7A-201ENST00000332160 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.971e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 METTL7A-203ENST00000548553 4076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.071e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.571e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.49e-7■■■■■ 36.6
DDX6P26196 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.419e-7■■■■■ 36.6
DDX6P26196 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.569e-7■■■■■ 36.6
DDX6P26196 RPS21-202ENST00000370562 1002 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.31e-18■■■■■ 36.4
DDX6P26196 RPS21-205ENST00000492356 429 ntTSL 1 (best)13.1□□□□□ -0.311e-18■■■■■ 36.4
DDX6P26196 RPS21-203ENST00000370592 401 ntTSL 212.95□□□□□ -0.341e-18■■■■■ 36.4
DDX6P26196 RPS21-204ENST00000450116 418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.491e-18■■■■■ 36.4
DDX6P26196 RPS21-201ENST00000343986 344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.761e-18■■■■■ 36.4
DDX6P26196 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.946e-6■■■■■ 36.3
DDX6P26196 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.38e-7■■■■■ 36.2
DDX6P26196 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.553e-6■■■■■ 36.1
DDX6P26196 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.43e-6■■■■■ 36.1
DDX6P26196 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 36.1
DDX6P26196 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 36.1
DDX6P26196 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 36.1
DDX6P26196 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.284e-20■■■■■ 36
DDX6P26196 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.194e-20■■■■■ 36
DDX6P26196 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.184e-20■■■■■ 36
DDX6P26196 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 35.7
DDX6P26196 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 35.7
DDX6P26196 ATXN7L3-205ENST00000587097 1341 ntTSL 532.38■■■□□ 2.773e-6■■■■■ 35.7
DDX6P26196 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.535e-6■■■■■ 35.5
DDX6P26196 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -05e-6■■■■■ 35.5
DDX6P26196 DENND1A-206ENST00000473039 4800 ntTSL 1 (best)10.96□□□□□ -0.665e-6■■■■■ 35.5
DDX6P26196 DENND1A-211ENST00000491650 842 ntTSL 510.43□□□□□ -0.745e-6■■■■■ 35.5
DDX6P26196 DENND1A-204ENST00000394215 1380 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.935e-6■■■■■ 35.5
DDX6P26196 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.322e-6■■■■■ 35.4
DDX6P26196 SENP3-209ENST00000610454 606 ntTSL 314.27□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 35.4
DDX6P26196 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 35.4
DDX6P26196 SENP3-203ENST00000580231 901 ntTSL 39.08□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 35.4
DDX6P26196 SENP3-205ENST00000581010 527 nt7.68□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 35.4
DDX6P26196 SENP3-206ENST00000581093 493 ntTSL 56.44□□□□□ -1.382e-6■■■■■ 35.4
DDX6P26196 SENP3-207ENST00000582789 536 ntTSL 26.07□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 35.4
DDX6P26196 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 35.4
DDX6P26196 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.354e-6■■■■■ 35.2
DDX6P26196 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 35.2
DDX6P26196 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 35.2
DDX6P26196 ADARB1-208ENST00000462214 587 ntTSL 38.96□□□□□ -0.983e-13■■■■■ 35.2
DDX6P26196 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.288e-9■■■■■ 35.1
DDX6P26196 ANAPC11-222ENST00000585259 345 ntTSL 516.61■□□□□ 0.258e-9■■■■■ 35.1
DDX6P26196 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.218e-9■■■■■ 35.1
DDX6P26196 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.128e-9■■■■■ 35.1
DDX6P26196 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 08e-9■■■■■ 35.1
DDX6P26196 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.038e-9■■■■■ 35.1
DDX6P26196 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.535e-7■■■■■ 35
DDX6P26196 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 35
DDX6P26196 PCMTD2-203ENST00000308824 3843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.735e-7■■■■■ 35
DDX6P26196 ASGR2-206ENST00000576487 1055 ntTSL 1 (best)16.72■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 35
DDX6P26196 ASGR2-205ENST00000574868 1202 ntTSL 516.21■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 35
DDX6P26196 ASGR2-204ENST00000450034 932 ntTSL 214.93□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 35
DDX6P26196 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 35
DDX6P26196 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 35
DDX6P26196 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 35
DDX6P26196 SMPD4-207ENST00000435455 842 ntTSL 517.3■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 34.9
DDX6P26196 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 34.9
DDX6P26196 SMPD4-204ENST00000430682 820 ntTSL 313.32□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 34.9
DDX6P26196 SMPD4-212ENST00000451542 796 ntTSL 512.81□□□□□ -0.362e-8■■■■■ 34.9
DDX6P26196 SMPD4-217ENST00000473720 555 ntTSL 412.79□□□□□ -0.362e-8■■■■■ 34.9
DDX6P26196 SMPD4-213ENST00000454468 3586 ntTSL 1 (best)11.47□□□□□ -0.572e-8■■■■■ 34.9
DDX6P26196 SMPD4-205ENST00000431183 3614 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.622e-8■■■■■ 34.9
DDX6P26196 SMPD4-209ENST00000439886 3371 ntTSL 211□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 34.9
DDX6P26196 SMPD4-208ENST00000439029 566 ntTSL 410.55□□□□□ -0.722e-8■■■■■ 34.9
DDX6P26196 SMPD4-206ENST00000433118 3335 ntTSL 510.09□□□□□ -0.792e-8■■■■■ 34.9
DDX6P26196 SMPD4-201ENST00000351288 3661 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.812e-8■■■■■ 34.9
DDX6P26196 SMPD4-203ENST00000412570 3601 ntTSL 29.7□□□□□ -0.862e-8■■■■■ 34.9
DDX6P26196 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.368e-7■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.35e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.015e-11■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.735e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 KMT5C-202ENST00000402499 888 ntTSL 224.69■■□□□ 1.545e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.545e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 ADAM15-210ENST00000461234 1069 ntTSL 224.58■■□□□ 1.537e-8■■■■■ 34.8
DDX6P26196 ADAM15-223ENST00000498481 1119 ntTSL 224.58■■□□□ 1.537e-8■■■■■ 34.8
DDX6P26196 MRPL38-204ENST00000464758 752 ntTSL 323.61■■□□□ 1.375e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.345e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 MGAT4B-216ENST00000520969 1096 ntTSL 323.39■■□□□ 1.335e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 ADAM15-218ENST00000474709 731 ntTSL 523.03■■□□□ 1.287e-8■■■■■ 34.8
DDX6P26196 SPPL2B-204ENST00000587851 586 ntTSL 322.89■■□□□ 1.255e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.235e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 MRPL38-216ENST00000585475 580 ntTSL 522.6■■□□□ 1.215e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.185e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.185e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 MGAT4B-205ENST00000518778 1568 ntTSL 1 (best)22.18■■□□□ 1.145e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.075e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TNFRSF12A-203ENST00000571351 1678 ntTSL 221.19■□□□□ 0.985e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 MYO18A-218ENST00000546105 1442 ntTSL 221.16■□□□□ 0.981e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.975e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 MGAT4B-209ENST00000519836 1686 ntTSL 1 (best)20.86■□□□□ 0.935e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 MKNK2-205ENST00000586828 1503 ntTSL 220.77■□□□□ 0.925e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.95e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.95e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 MRPL38-213ENST00000493104 1116 ntTSL 220.6■□□□□ 0.895e-6■■■■■ 34.8
Retrieved 100 of 14,483 protein–RNA pairs in 123.4 ms