Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3P25205 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3P25205 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3P25205 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3P25205 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3P25205 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3P25205 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3P25205 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3P25205 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3P25205 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3P25205 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3P25205 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3P25205 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM3P25205 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM3P25205 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM3P25205 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM3P25205 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM3P25205 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM3P25205 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM3P25205 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM3P25205 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM3P25205 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM3P25205 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM3P25205 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM3P25205 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM3P25205 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM3P25205 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM3P25205 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM3P25205 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM3P25205 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM3P25205 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM3P25205 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM3P25205 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM3P25205 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM3P25205 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM3P25205 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM3P25205 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM3P25205 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3P25205 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3P25205 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3P25205 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3P25205 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3P25205 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3P25205 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3P25205 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3P25205 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3P25205 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3P25205 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM3P25205 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM3P25205 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM3P25205 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM3P25205 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM3P25205 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM3P25205 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM3P25205 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM3P25205 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM3P25205 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM3P25205 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM3P25205 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM3P25205 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM3P25205 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM3P25205 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM3P25205 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCM3P25205 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCM3P25205 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM3P25205 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM3P25205 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM3P25205 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM3P25205 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM3P25205 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM3P25205 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM3P25205 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM3P25205 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM3P25205 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM3P25205 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM3P25205 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM3P25205 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3P25205 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3P25205 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3P25205 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3P25205 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3P25205 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3P25205 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3P25205 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3P25205 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3P25205 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3P25205 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3P25205 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3P25205 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3P25205 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3P25205 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3P25205 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3P25205 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3P25205 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3P25205 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM3P25205 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM3P25205 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM3P25205 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM3P25205 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM3P25205 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms