Protein–RNA interactions for Protein: P23975

SLC6A2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A2P23975 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC6A2P23975 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms