Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP2B4P23634 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ATP2B4P23634 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms