Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EIF4BP23588 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF4BP23588 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms