Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
HRCP23327 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.38
HRCP23327 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
HRCP23327 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
HRCP23327 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
HRCP23327 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
HRCP23327 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
HRCP23327 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
HRCP23327 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
HRCP23327 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
HRCP23327 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
HRCP23327 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
HRCP23327 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
HRCP23327 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
HRCP23327 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
HRCP23327 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
HRCP23327 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
HRCP23327 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
HRCP23327 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
HRCP23327 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
HRCP23327 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
HRCP23327 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
HRCP23327 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
HRCP23327 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
HRCP23327 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
HRCP23327 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
HRCP23327 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
HRCP23327 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
HRCP23327 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
HRCP23327 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
HRCP23327 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
HRCP23327 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
HRCP23327 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
HRCP23327 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
HRCP23327 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
HRCP23327 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
HRCP23327 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
HRCP23327 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
HRCP23327 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
HRCP23327 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
HRCP23327 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
HRCP23327 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
HRCP23327 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
HRCP23327 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
HRCP23327 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
HRCP23327 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
HRCP23327 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
HRCP23327 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
HRCP23327 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
HRCP23327 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
HRCP23327 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
HRCP23327 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
HRCP23327 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
HRCP23327 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
HRCP23327 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
HRCP23327 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
HRCP23327 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
HRCP23327 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
HRCP23327 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
HRCP23327 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
HRCP23327 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
HRCP23327 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
HRCP23327 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
HRCP23327 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
HRCP23327 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
HRCP23327 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
HRCP23327 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
HRCP23327 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
HRCP23327 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
HRCP23327 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
HRCP23327 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
HRCP23327 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
HRCP23327 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
HRCP23327 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
HRCP23327 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
HRCP23327 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
HRCP23327 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
HRCP23327 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
HRCP23327 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
HRCP23327 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
HRCP23327 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
HRCP23327 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
HRCP23327 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
HRCP23327 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
HRCP23327 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
HRCP23327 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
HRCP23327 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
HRCP23327 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
HRCP23327 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
HRCP23327 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
HRCP23327 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
HRCP23327 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
HRCP23327 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
HRCP23327 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
HRCP23327 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
HRCP23327 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
HRCP23327 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
HRCP23327 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
HRCP23327 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
HRCP23327 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms