Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBG1P23258 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms