Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGFR3P22607 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms