Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCP2P22307 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCP2P22307 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCP2P22307 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCP2P22307 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCP2P22307 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCP2P22307 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCP2P22307 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCP2P22307 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCP2P22307 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCP2P22307 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCP2P22307 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCP2P22307 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCP2P22307 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCP2P22307 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCP2P22307 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCP2P22307 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCP2P22307 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SCP2P22307 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SCP2P22307 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCP2P22307 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCP2P22307 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCP2P22307 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCP2P22307 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCP2P22307 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCP2P22307 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCP2P22307 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCP2P22307 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCP2P22307 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCP2P22307 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCP2P22307 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCP2P22307 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCP2P22307 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCP2P22307 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCP2P22307 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCP2P22307 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCP2P22307 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCP2P22307 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCP2P22307 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCP2P22307 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCP2P22307 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCP2P22307 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCP2P22307 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCP2P22307 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCP2P22307 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCP2P22307 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCP2P22307 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCP2P22307 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCP2P22307 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCP2P22307 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCP2P22307 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCP2P22307 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCP2P22307 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCP2P22307 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCP2P22307 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCP2P22307 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCP2P22307 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCP2P22307 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCP2P22307 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCP2P22307 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCP2P22307 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCP2P22307 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCP2P22307 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCP2P22307 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCP2P22307 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCP2P22307 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCP2P22307 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCP2P22307 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SCP2P22307 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCP2P22307 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCP2P22307 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCP2P22307 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCP2P22307 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCP2P22307 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCP2P22307 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCP2P22307 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCP2P22307 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCP2P22307 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCP2P22307 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCP2P22307 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCP2P22307 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCP2P22307 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCP2P22307 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCP2P22307 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCP2P22307 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCP2P22307 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCP2P22307 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCP2P22307 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCP2P22307 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SCP2P22307 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCP2P22307 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCP2P22307 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCP2P22307 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCP2P22307 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCP2P22307 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCP2P22307 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCP2P22307 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCP2P22307 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCP2P22307 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCP2P22307 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms