Protein–RNA interactions for Protein: P21926

CD9, CD9 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD9P21926 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD9P21926 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD9P21926 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD9P21926 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD9P21926 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CD9P21926 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD9P21926 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD9P21926 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD9P21926 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD9P21926 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD9P21926 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD9P21926 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD9P21926 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD9P21926 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD9P21926 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD9P21926 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD9P21926 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD9P21926 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD9P21926 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD9P21926 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD9P21926 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD9P21926 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD9P21926 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CD9P21926 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD9P21926 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD9P21926 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD9P21926 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD9P21926 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD9P21926 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD9P21926 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD9P21926 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD9P21926 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD9P21926 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD9P21926 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CD9P21926 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD9P21926 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CD9P21926 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD9P21926 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD9P21926 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD9P21926 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD9P21926 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD9P21926 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD9P21926 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD9P21926 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD9P21926 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD9P21926 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD9P21926 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD9P21926 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD9P21926 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD9P21926 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CD9P21926 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD9P21926 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD9P21926 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD9P21926 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD9P21926 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD9P21926 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD9P21926 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD9P21926 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD9P21926 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD9P21926 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CD9P21926 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD9P21926 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD9P21926 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD9P21926 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD9P21926 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD9P21926 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD9P21926 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD9P21926 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD9P21926 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD9P21926 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD9P21926 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD9P21926 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD9P21926 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD9P21926 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD9P21926 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD9P21926 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD9P21926 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD9P21926 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD9P21926 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD9P21926 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD9P21926 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CD9P21926 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD9P21926 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD9P21926 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD9P21926 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD9P21926 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD9P21926 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD9P21926 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD9P21926 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD9P21926 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD9P21926 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD9P21926 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD9P21926 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD9P21926 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CD9P21926 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD9P21926 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD9P21926 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD9P21926 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD9P21926 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD9P21926 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms