Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NR1D1P20393 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR1D1P20393 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms