Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF1BP20333 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF1BP20333 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF1BP20333 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF1BP20333 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF1BP20333 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF1BP20333 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF1BP20333 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF1BP20333 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF1BP20333 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF1BP20333 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF1BP20333 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF1BP20333 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF1BP20333 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF1BP20333 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF1BP20333 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF1BP20333 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF1BP20333 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF1BP20333 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF1BP20333 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNFRSF1BP20333 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF1BP20333 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms