Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFEBP19484 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFEBP19484 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFEBP19484 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFEBP19484 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFEBP19484 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFEBP19484 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFEBP19484 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFEBP19484 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFEBP19484 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFEBP19484 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFEBP19484 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFEBP19484 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFEBP19484 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFEBP19484 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFEBP19484 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFEBP19484 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFEBP19484 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFEBP19484 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFEBP19484 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TFEBP19484 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFEBP19484 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFEBP19484 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFEBP19484 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFEBP19484 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFEBP19484 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFEBP19484 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFEBP19484 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFEBP19484 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFEBP19484 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFEBP19484 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFEBP19484 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFEBP19484 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFEBP19484 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFEBP19484 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFEBP19484 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFEBP19484 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFEBP19484 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFEBP19484 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TFEBP19484 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFEBP19484 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFEBP19484 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFEBP19484 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFEBP19484 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFEBP19484 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFEBP19484 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFEBP19484 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFEBP19484 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFEBP19484 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFEBP19484 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFEBP19484 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFEBP19484 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TFEBP19484 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFEBP19484 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFEBP19484 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFEBP19484 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFEBP19484 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFEBP19484 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFEBP19484 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TFEBP19484 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFEBP19484 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TFEBP19484 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TFEBP19484 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFEBP19484 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TFEBP19484 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TFEBP19484 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TFEBP19484 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFEBP19484 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TFEBP19484 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFEBP19484 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFEBP19484 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFEBP19484 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TFEBP19484 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFEBP19484 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFEBP19484 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TFEBP19484 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFEBP19484 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFEBP19484 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFEBP19484 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFEBP19484 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFEBP19484 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFEBP19484 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFEBP19484 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFEBP19484 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFEBP19484 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFEBP19484 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFEBP19484 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFEBP19484 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TFEBP19484 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TFEBP19484 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFEBP19484 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFEBP19484 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFEBP19484 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFEBP19484 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFEBP19484 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFEBP19484 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFEBP19484 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFEBP19484 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFEBP19484 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFEBP19484 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms