Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VCAM1P19320 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VCAM1P19320 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms