Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17P18621 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17P18621 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17P18621 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17P18621 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17P18621 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL17P18621 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL17P18621 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL17P18621 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL17P18621 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL17P18621 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL17P18621 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL17P18621 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL17P18621 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL17P18621 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL17P18621 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL17P18621 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL17P18621 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL17P18621 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL17P18621 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL17P18621 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL17P18621 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL17P18621 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL17P18621 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL17P18621 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL17P18621 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL17P18621 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL17P18621 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL17P18621 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL17P18621 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL17P18621 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPL17P18621 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPL17P18621 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPL17P18621 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPL17P18621 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPL17P18621 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RPL17P18621 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
RPL17P18621 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPL17P18621 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL17P18621 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL17P18621 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL17P18621 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL17P18621 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL17P18621 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL17P18621 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL17P18621 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL17P18621 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL17P18621 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL17P18621 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL17P18621 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL17P18621 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL17P18621 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL17P18621 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL17P18621 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL17P18621 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL17P18621 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17P18621 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17P18621 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17P18621 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17P18621 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17P18621 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17P18621 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17P18621 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17P18621 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17P18621 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17P18621 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17P18621 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17P18621 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17P18621 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17P18621 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17P18621 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17P18621 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17P18621 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17P18621 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17P18621 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17P18621 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17P18621 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17P18621 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17P18621 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17P18621 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17P18621 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17P18621 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17P18621 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17P18621 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17P18621 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17P18621 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17P18621 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17P18621 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL17P18621 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL17P18621 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL17P18621 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL17P18621 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL17P18621 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL17P18621 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL17P18621 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL17P18621 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL17P18621 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL17P18621 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL17P18621 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPL17P18621 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms