Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC2P18074 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms