Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GM2AP17900 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GM2AP17900 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GM2AP17900 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GM2AP17900 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GM2AP17900 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GM2AP17900 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GM2AP17900 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GM2AP17900 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GM2AP17900 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GM2AP17900 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GM2AP17900 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GM2AP17900 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GM2AP17900 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GM2AP17900 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GM2AP17900 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GM2AP17900 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GM2AP17900 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GM2AP17900 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GM2AP17900 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GM2AP17900 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GM2AP17900 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GM2AP17900 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GM2AP17900 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GM2AP17900 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GM2AP17900 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GM2AP17900 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GM2AP17900 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GM2AP17900 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GM2AP17900 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GM2AP17900 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GM2AP17900 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GM2AP17900 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GM2AP17900 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GM2AP17900 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GM2AP17900 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GM2AP17900 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GM2AP17900 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GM2AP17900 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GM2AP17900 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GM2AP17900 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GM2AP17900 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GM2AP17900 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GM2AP17900 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GM2AP17900 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GM2AP17900 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GM2AP17900 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GM2AP17900 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GM2AP17900 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GM2AP17900 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GM2AP17900 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GM2AP17900 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GM2AP17900 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GM2AP17900 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GM2AP17900 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GM2AP17900 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GM2AP17900 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GM2AP17900 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GM2AP17900 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GM2AP17900 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GM2AP17900 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GM2AP17900 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GM2AP17900 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GM2AP17900 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GM2AP17900 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GM2AP17900 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GM2AP17900 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GM2AP17900 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GM2AP17900 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GM2AP17900 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GM2AP17900 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GM2AP17900 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GM2AP17900 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GM2AP17900 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GM2AP17900 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GM2AP17900 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GM2AP17900 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GM2AP17900 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GM2AP17900 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GM2AP17900 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GM2AP17900 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GM2AP17900 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GM2AP17900 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GM2AP17900 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GM2AP17900 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GM2AP17900 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GM2AP17900 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GM2AP17900 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GM2AP17900 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GM2AP17900 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GM2AP17900 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GM2AP17900 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GM2AP17900 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GM2AP17900 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GM2AP17900 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GM2AP17900 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GM2AP17900 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GM2AP17900 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GM2AP17900 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GM2AP17900 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms