Protein–RNA interactions for Protein: P17676

CEBPB, CCAAT/enhancer-binding protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPBP17676 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEBPBP17676 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEBPBP17676 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms