Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCFC2P16383 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCFC2P16383 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCFC2P16383 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCFC2P16383 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCFC2P16383 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCFC2P16383 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCFC2P16383 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCFC2P16383 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCFC2P16383 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCFC2P16383 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GCFC2P16383 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCFC2P16383 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCFC2P16383 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCFC2P16383 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCFC2P16383 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCFC2P16383 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCFC2P16383 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCFC2P16383 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCFC2P16383 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GCFC2P16383 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GCFC2P16383 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCFC2P16383 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms