Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD44P16070 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD44P16070 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD44P16070 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD44P16070 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD44P16070 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD44P16070 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CD44P16070 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CD44P16070 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CD44P16070 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CD44P16070 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CD44P16070 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD44P16070 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD44P16070 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD44P16070 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD44P16070 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD44P16070 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD44P16070 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD44P16070 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD44P16070 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD44P16070 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD44P16070 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD44P16070 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD44P16070 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD44P16070 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD44P16070 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD44P16070 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD44P16070 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD44P16070 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD44P16070 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD44P16070 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD44P16070 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD44P16070 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD44P16070 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD44P16070 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD44P16070 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD44P16070 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD44P16070 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CD44P16070 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD44P16070 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD44P16070 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD44P16070 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD44P16070 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD44P16070 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD44P16070 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD44P16070 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD44P16070 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD44P16070 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD44P16070 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD44P16070 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD44P16070 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD44P16070 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD44P16070 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD44P16070 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD44P16070 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD44P16070 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD44P16070 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD44P16070 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD44P16070 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD44P16070 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD44P16070 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD44P16070 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CD44P16070 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CD44P16070 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD44P16070 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD44P16070 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD44P16070 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD44P16070 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD44P16070 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD44P16070 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CD44P16070 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CD44P16070 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD44P16070 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD44P16070 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD44P16070 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD44P16070 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD44P16070 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD44P16070 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD44P16070 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD44P16070 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD44P16070 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD44P16070 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CD44P16070 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD44P16070 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD44P16070 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD44P16070 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD44P16070 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD44P16070 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD44P16070 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD44P16070 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD44P16070 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CD44P16070 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD44P16070 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD44P16070 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD44P16070 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD44P16070 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD44P16070 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD44P16070 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CD44P16070 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD44P16070 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms