Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCF3P15923 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCF3P15923 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCF3P15923 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF3P15923 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF3P15923 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF3P15923 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF3P15923 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF3P15923 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF3P15923 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF3P15923 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF3P15923 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF3P15923 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF3P15923 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF3P15923 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF3P15923 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF3P15923 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF3P15923 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF3P15923 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF3P15923 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF3P15923 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF3P15923 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF3P15923 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF3P15923 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF3P15923 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF3P15923 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF3P15923 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF3P15923 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF3P15923 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF3P15923 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF3P15923 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF3P15923 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF3P15923 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF3P15923 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF3P15923 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF3P15923 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF3P15923 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF3P15923 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF3P15923 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF3P15923 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF3P15923 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF3P15923 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF3P15923 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF3P15923 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF3P15923 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF3P15923 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF3P15923 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF3P15923 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF3P15923 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF3P15923 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF3P15923 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF3P15923 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF3P15923 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF3P15923 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF3P15923 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF3P15923 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF3P15923 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF3P15923 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF3P15923 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF3P15923 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCF3P15923 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCF3P15923 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCF3P15923 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCF3P15923 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TCF3P15923 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF3P15923 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF3P15923 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF3P15923 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF3P15923 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF3P15923 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF3P15923 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF3P15923 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF3P15923 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF3P15923 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF3P15923 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF3P15923 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF3P15923 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF3P15923 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF3P15923 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF3P15923 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF3P15923 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF3P15923 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF3P15923 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCF3P15923 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF3P15923 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF3P15923 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF3P15923 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF3P15923 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF3P15923 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF3P15923 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF3P15923 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF3P15923 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF3P15923 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF3P15923 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF3P15923 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF3P15923 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF3P15923 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF3P15923 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF3P15923 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF3P15923 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms