Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC130P13994 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms