Protein–RNA interactions for Protein: P13674

P4HA1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4HA1P13674 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
P4HA1P13674 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
P4HA1P13674 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
P4HA1P13674 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms