Protein–RNA interactions for Protein: P13591

NCAM1, Neural cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM1P13591 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAM1P13591 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAM1P13591 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAM1P13591 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAM1P13591 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAM1P13591 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAM1P13591 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAM1P13591 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAM1P13591 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAM1P13591 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAM1P13591 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAM1P13591 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAM1P13591 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCAM1P13591 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCAM1P13591 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAM1P13591 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms