Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL6A2P12110 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms