Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CETPP11597 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CETPP11597 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CETPP11597 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CETPP11597 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CETPP11597 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CETPP11597 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CETPP11597 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CETPP11597 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CETPP11597 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CETPP11597 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CETPP11597 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CETPP11597 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CETPP11597 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CETPP11597 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CETPP11597 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CETPP11597 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CETPP11597 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CETPP11597 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CETPP11597 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CETPP11597 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CETPP11597 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CETPP11597 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CETPP11597 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CETPP11597 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CETPP11597 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CETPP11597 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CETPP11597 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CETPP11597 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CETPP11597 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CETPP11597 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CETPP11597 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CETPP11597 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CETPP11597 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CETPP11597 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CETPP11597 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CETPP11597 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CETPP11597 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CETPP11597 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CETPP11597 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CETPP11597 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CETPP11597 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CETPP11597 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CETPP11597 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CETPP11597 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CETPP11597 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CETPP11597 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CETPP11597 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CETPP11597 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CETPP11597 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CETPP11597 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CETPP11597 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CETPP11597 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CETPP11597 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CETPP11597 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CETPP11597 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CETPP11597 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CETPP11597 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CETPP11597 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CETPP11597 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CETPP11597 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CETPP11597 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CETPP11597 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CETPP11597 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CETPP11597 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CETPP11597 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CETPP11597 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CETPP11597 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CETPP11597 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CETPP11597 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CETPP11597 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CETPP11597 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CETPP11597 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CETPP11597 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CETPP11597 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CETPP11597 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CETPP11597 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CETPP11597 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CETPP11597 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CETPP11597 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CETPP11597 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CETPP11597 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CETPP11597 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CETPP11597 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CETPP11597 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CETPP11597 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CETPP11597 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CETPP11597 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CETPP11597 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CETPP11597 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CETPP11597 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CETPP11597 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CETPP11597 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CETPP11597 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CETPP11597 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CETPP11597 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CETPP11597 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CETPP11597 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CETPP11597 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CETPP11597 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms