Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms