Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms