Protein–RNA interactions for Protein: P09923

ALPI, Intestinal-type alkaline phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPIP09923 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPIP09923 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPIP09923 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPIP09923 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPIP09923 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPIP09923 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPIP09923 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPIP09923 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPIP09923 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPIP09923 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALPIP09923 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALPIP09923 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALPIP09923 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALPIP09923 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPIP09923 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPIP09923 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPIP09923 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPIP09923 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPIP09923 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPIP09923 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPIP09923 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPIP09923 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPIP09923 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPIP09923 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPIP09923 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPIP09923 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPIP09923 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPIP09923 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPIP09923 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPIP09923 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPIP09923 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPIP09923 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPIP09923 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPIP09923 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPIP09923 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPIP09923 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPIP09923 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPIP09923 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPIP09923 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPIP09923 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPIP09923 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPIP09923 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPIP09923 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPIP09923 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPIP09923 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPIP09923 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPIP09923 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPIP09923 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPIP09923 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPIP09923 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPIP09923 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPIP09923 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPIP09923 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPIP09923 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPIP09923 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPIP09923 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPIP09923 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ALPIP09923 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALPIP09923 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPIP09923 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPIP09923 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPIP09923 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPIP09923 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPIP09923 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPIP09923 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPIP09923 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPIP09923 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPIP09923 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPIP09923 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPIP09923 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPIP09923 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPIP09923 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPIP09923 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPIP09923 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPIP09923 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPIP09923 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPIP09923 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPIP09923 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPIP09923 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPIP09923 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPIP09923 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPIP09923 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPIP09923 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPIP09923 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPIP09923 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPIP09923 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPIP09923 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALPIP09923 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALPIP09923 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALPIP09923 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALPIP09923 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALPIP09923 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALPIP09923 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALPIP09923 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALPIP09923 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALPIP09923 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALPIP09923 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALPIP09923 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALPIP09923 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALPIP09923 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms