Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC4P09017 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXC4P09017 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms