Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CYP3A4P08684 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP3A4P08684 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP3A4P08684 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms