Protein–RNA interactions for Protein: P08579

SNRPB2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPB2P08579 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPB2P08579 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms