Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRCP08575 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRCP08575 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms