Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAP2AP05549 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TFAP2AP05549 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TFAP2AP05549 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TFAP2AP05549 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TFAP2AP05549 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TFAP2AP05549 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFAP2AP05549 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFAP2AP05549 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFAP2AP05549 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TFAP2AP05549 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFAP2AP05549 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TFAP2AP05549 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFAP2AP05549 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms