Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPTA1P02549 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPTA1P02549 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SPTA1P02549 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTA1P02549 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPTA1P02549 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTA1P02549 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTA1P02549 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTA1P02549 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTA1P02549 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPTA1P02549 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTA1P02549 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPTA1P02549 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTA1P02549 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTA1P02549 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTA1P02549 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTA1P02549 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTA1P02549 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTA1P02549 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTA1P02549 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTA1P02549 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTA1P02549 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTA1P02549 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTA1P02549 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPTA1P02549 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTA1P02549 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTA1P02549 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTA1P02549 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPTA1P02549 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTA1P02549 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTA1P02549 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTA1P02549 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTA1P02549 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTA1P02549 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTA1P02549 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPTA1P02549 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTA1P02549 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTA1P02549 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTA1P02549 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPTA1P02549 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPTA1P02549 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPTA1P02549 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPTA1P02549 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPTA1P02549 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPTA1P02549 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTA1P02549 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTA1P02549 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPTA1P02549 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPTA1P02549 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTA1P02549 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms