Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINA1P01009 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINA1P01009 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINA1P01009 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms