Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EGFRP00533 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EGFRP00533 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
EGFRP00533 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EGFRP00533 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EGFRP00533 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EGFRP00533 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EGFRP00533 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EGFRP00533 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EGFRP00533 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EGFRP00533 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EGFRP00533 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EGFRP00533 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EGFRP00533 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EGFRP00533 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EGFRP00533 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EGFRP00533 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EGFRP00533 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EGFRP00533 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EGFRP00533 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EGFRP00533 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EGFRP00533 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EGFRP00533 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EGFRP00533 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EGFRP00533 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EGFRP00533 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EGFRP00533 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EGFRP00533 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EGFRP00533 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EGFRP00533 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EGFRP00533 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EGFRP00533 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EGFRP00533 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EGFRP00533 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EGFRP00533 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EGFRP00533 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EGFRP00533 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EGFRP00533 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EGFRP00533 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EGFRP00533 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EGFRP00533 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EGFRP00533 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EGFRP00533 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EGFRP00533 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EGFRP00533 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EGFRP00533 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EGFRP00533 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EGFRP00533 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EGFRP00533 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EGFRP00533 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EGFRP00533 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EGFRP00533 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EGFRP00533 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EGFRP00533 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EGFRP00533 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EGFRP00533 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EGFRP00533 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EGFRP00533 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EGFRP00533 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EGFRP00533 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EGFRP00533 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EGFRP00533 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EGFRP00533 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EGFRP00533 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EGFRP00533 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EGFRP00533 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EGFRP00533 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EGFRP00533 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EGFRP00533 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EGFRP00533 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EGFRP00533 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EGFRP00533 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EGFRP00533 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EGFRP00533 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EGFRP00533 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EGFRP00533 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EGFRP00533 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EGFRP00533 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EGFRP00533 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EGFRP00533 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EGFRP00533 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EGFRP00533 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EGFRP00533 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EGFRP00533 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EGFRP00533 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EGFRP00533 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EGFRP00533 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EGFRP00533 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EGFRP00533 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EGFRP00533 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EGFRP00533 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EGFRP00533 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EGFRP00533 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EGFRP00533 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EGFRP00533 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EGFRP00533 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EGFRP00533 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EGFRP00533 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
EGFRP00533 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EGFRP00533 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms