Protein–RNA interactions for Protein: P00450

CP, Ceruloplasmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPP00450 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPP00450 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CPP00450 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPP00450 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPP00450 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPP00450 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CPP00450 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPP00450 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPP00450 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPP00450 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPP00450 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPP00450 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPP00450 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPP00450 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPP00450 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPP00450 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPP00450 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPP00450 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CPP00450 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPP00450 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CPP00450 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CPP00450 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPP00450 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPP00450 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPP00450 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPP00450 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPP00450 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPP00450 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPP00450 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPP00450 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPP00450 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPP00450 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPP00450 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPP00450 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPP00450 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPP00450 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPP00450 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPP00450 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CPP00450 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPP00450 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPP00450 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPP00450 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPP00450 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPP00450 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPP00450 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPP00450 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPP00450 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPP00450 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPP00450 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CPP00450 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CPP00450 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPP00450 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CPP00450 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPP00450 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPP00450 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPP00450 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPP00450 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CPP00450 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPP00450 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPP00450 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPP00450 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPP00450 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPP00450 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPP00450 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPP00450 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPP00450 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPP00450 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPP00450 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPP00450 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CPP00450 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CPP00450 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPP00450 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPP00450 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPP00450 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPP00450 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPP00450 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPP00450 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPP00450 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPP00450 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPP00450 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPP00450 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPP00450 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPP00450 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPP00450 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPP00450 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPP00450 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CPP00450 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPP00450 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPP00450 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPP00450 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPP00450 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CPP00450 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPP00450 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPP00450 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPP00450 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPP00450 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPP00450 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPP00450 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPP00450 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPP00450 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms