Protein–RNA interactions for Protein: O95947

TBX6, T-box transcription factor TBX6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX6O95947 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBX6O95947 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBX6O95947 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBX6O95947 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBX6O95947 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBX6O95947 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TBX6O95947 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBX6O95947 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBX6O95947 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBX6O95947 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBX6O95947 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBX6O95947 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBX6O95947 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TBX6O95947 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBX6O95947 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBX6O95947 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBX6O95947 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBX6O95947 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TBX6O95947 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBX6O95947 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBX6O95947 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TBX6O95947 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBX6O95947 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBX6O95947 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBX6O95947 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBX6O95947 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TBX6O95947 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBX6O95947 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TBX6O95947 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBX6O95947 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBX6O95947 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBX6O95947 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBX6O95947 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBX6O95947 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBX6O95947 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBX6O95947 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBX6O95947 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBX6O95947 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBX6O95947 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBX6O95947 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBX6O95947 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBX6O95947 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBX6O95947 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBX6O95947 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TBX6O95947 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBX6O95947 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBX6O95947 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBX6O95947 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBX6O95947 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBX6O95947 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBX6O95947 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBX6O95947 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBX6O95947 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBX6O95947 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBX6O95947 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBX6O95947 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBX6O95947 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBX6O95947 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBX6O95947 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBX6O95947 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBX6O95947 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBX6O95947 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBX6O95947 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX6O95947 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX6O95947 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX6O95947 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX6O95947 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX6O95947 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX6O95947 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX6O95947 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX6O95947 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX6O95947 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX6O95947 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX6O95947 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX6O95947 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX6O95947 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX6O95947 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX6O95947 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX6O95947 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX6O95947 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX6O95947 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX6O95947 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX6O95947 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX6O95947 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX6O95947 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX6O95947 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX6O95947 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX6O95947 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX6O95947 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX6O95947 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX6O95947 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX6O95947 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX6O95947 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX6O95947 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX6O95947 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX6O95947 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX6O95947 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX6O95947 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX6O95947 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX6O95947 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms