Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYF2O95926 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYF2O95926 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYF2O95926 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYF2O95926 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYF2O95926 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYF2O95926 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYF2O95926 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYF2O95926 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYF2O95926 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYF2O95926 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYF2O95926 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYF2O95926 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYF2O95926 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYF2O95926 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYF2O95926 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYF2O95926 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYF2O95926 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYF2O95926 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYF2O95926 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYF2O95926 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYF2O95926 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYF2O95926 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYF2O95926 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYF2O95926 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYF2O95926 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYF2O95926 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYF2O95926 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYF2O95926 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYF2O95926 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYF2O95926 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYF2O95926 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYF2O95926 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYF2O95926 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYF2O95926 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYF2O95926 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYF2O95926 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYF2O95926 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYF2O95926 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYF2O95926 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYF2O95926 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYF2O95926 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYF2O95926 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYF2O95926 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYF2O95926 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYF2O95926 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYF2O95926 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYF2O95926 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYF2O95926 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYF2O95926 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYF2O95926 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYF2O95926 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYF2O95926 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYF2O95926 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYF2O95926 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYF2O95926 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYF2O95926 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYF2O95926 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYF2O95926 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYF2O95926 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYF2O95926 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYF2O95926 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYF2O95926 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYF2O95926 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYF2O95926 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYF2O95926 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYF2O95926 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYF2O95926 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYF2O95926 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYF2O95926 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYF2O95926 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYF2O95926 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYF2O95926 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYF2O95926 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYF2O95926 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYF2O95926 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYF2O95926 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYF2O95926 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYF2O95926 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYF2O95926 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYF2O95926 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYF2O95926 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYF2O95926 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYF2O95926 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYF2O95926 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYF2O95926 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYF2O95926 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYF2O95926 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYF2O95926 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYF2O95926 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYF2O95926 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYF2O95926 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYF2O95926 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYF2O95926 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYF2O95926 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYF2O95926 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYF2O95926 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYF2O95926 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYF2O95926 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYF2O95926 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms