Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
POLR1AO95602 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
POLR1AO95602 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
POLR1AO95602 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms